第一部分介紹了計算機輔助藥物設計的發展概況與計算 機輔助藥物分子設計有關的統計和理論計算方法，包括數值和非數值優化方法、 分子力學方法、分子動力學方法、構象分析方法、溶劑效應以及自由能計算方 法;第二部分介紹了計算機輔助藥物分子設計中的主要方法，包括構效關系方 法、藥效團模型方法、從頭設計方法、分子對接方法、數據庫搜索方法、藥代 動力學以及毒性的預測方法;第三部分則選擇了兩個具體的實例，介紹了計算 機輔助藥物分子設計方法在藥物先導化合物發現和優化方面的應用。附錄一和 附錄二則簡要介紹了 CADD 方法中幾個常用的概念及列出了 CADD 中常用的軟 件和程序。在介紹 CADD 方法和應用的基礎上，本書還用了大量篇幅介紹 CADD中涉及的相關理論和計算方法，這部分內容涉及了較多的線性代數、高 等數學、分析力學、統計力學以及量子力學等學科的相關內容。這些理論計算 方法在CADD中應用非常廣泛或是某些CADD方法的重要組成部分，對其系統 的了解可以幫助讀者更加深入地理解后續章節中介紹的 CADD 方法。當然，這 幾章的內容也具有相對的獨立性，讀者完全可以跳過這部分內容而直接閱讀 CADD方法和應用的相關章節。本書沒有單獨分出章節介紹量子化學方法，主 要原因是這部分涉及的內容非常廣泛，在很小的篇幅內很難對其做出系統及有 效的闡述，此外，國內外關于這方面的專著也很多，有需要的作者可以參考有 關的著作。本書力求介紹 CADD 方法研究和應用領域的最新進展，但 CADD 是 國際上非常活躍的研究領域，發展速度很快，涉及的內容非常廣泛，加上作者 學識有限，在寫作的過程難免有遺漏和錯誤，懇請讀者批評和指正。 本書的第一章由徐筱杰教授執筆，第二章~第三章由喬學斌博士執筆，第 四章由侯廷軍博士和章威執筆，第五章~第六章由章威和侯廷軍博士執筆，第 七章~第十三章由侯廷軍博士執筆，第十四章由侯廷軍博士和喬學斌博士執筆， 第十五章~第十六章由侯廷軍博士執筆，附錄由侯廷軍博士、喬學斌博士和章 威共同完成。最后全書由徐筱杰教授和侯廷軍博士修改定稿。 本書是徐筱杰教授課題組多年研究工作的結晶，是組里一屆又一屆本科生、 研究生研究工作的經驗總結和積累。多年來我們的工作得到國內同行們的許多 支持與幫助，也得到養生堂藥業有限公司、創騰科技有限公司及凱鵬公司的大 力支持與幫助。作者特向他們致以衷心的感謝。書中引用了大量國內外同行發 表的一些寶貴資料，在此一并致謝。