資源簡介
這是maskrcnn keras代碼，針對細胞語義分割項目進行了專門的改造，代碼中有相應的示例，當這里的代碼去掉mask的生成過程，可以當做faster rcnn使用，這是進行細胞語義分割的完整項目，包含訓練、測試、記錄整個流程
代碼片段和文件信息
__authors__=“Jie?Yang?and?Xinyang?Feng“
import?glob
import?skimage.io
import?argparse
from?networkx.algorithms.components.connected?import?connected_components
import?os
import?numpy?as?np
from?skimage.color?import?label2rgb
import?pandas?as?pd
from?.nuclei_utils?import?deoverlap_masks?prob_to_rles?to_graph?compute_overlaps_masks?sweep_iou_mask_ap
def?ensemble_func（ensemble_dirs?=?None?MASK_ENSEMBLE_SAVE_PATH?=‘‘?IMAGE_PATH?=?‘‘?test_flag?=?True?iou_threshold?=?0.5）:
????test_ids?=?glob.glob（ensemble_dirs[0]+‘*_mask.npy‘）
????for?i?in?range（len（test_ids））:
????????test_ids[i]=test_ids[i].split（‘/‘）[-1].split（‘_mask‘）[0]
????num_models?=?len（ensemble_dirs）
????rles?=?[]
????new_test_ids?=?[]
????APs?=?[]
????for?test_id?in?test_ids:
????????print?（test_id）
????????detection_resu?屬性????????????大小?????日期????時間???名稱
-----------?---------??----------?-----??----
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?????文件??????????46??2018-05-30?11:01??Keras_maskrcnn\.gitignore
?????目錄???????????0??2019-04-12?09:15??Keras_maskrcnn\.idea\
?????文件?????????745??2019-03-28?13:32??Keras_maskrcnn\.idea\deployment.xm
?????文件?????????138??2019-03-28?11:04??Keras_maskrcnn\.idea\encodings.xm
?????文件?????????497??2019-04-02?19:37??Keras_maskrcnn\.idea\Keras_maskrcnn.iml
?????文件?????????294??2019-04-02?19:37??Keras_maskrcnn\.idea\misc.xm
?????文件?????????287??2019-03-28?11:04??Keras_maskrcnn\.idea\modules.xm
?????文件???????11586??2019-04-12?09:15??Keras_maskrcnn\.idea\workspace.xm
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?????文件????????6730??2018-05-30?11:01??Keras_maskrcnn\config\nuclei_config.py
?????文件???????????0??2019-03-28?11:06??Keras_maskrcnn\config\__init__.py
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?????目錄???????????0??2019-03-28?12:16??Keras_maskrcnn\dir\
?????文件???????36541??2019-03-28?11:34??Keras_maskrcnn\image_augment_refresh.png
?????文件?????????818??2018-05-30?11:01??Keras_maskrcnn\image_group_train.csv
?????目錄???????????0??2019-03-28?11:08??Keras_maskrcnn\model\
?????文件??????116958??2019-03-28?11:08??Keras_maskrcnn\model\nuclei_model.py
?????文件???????????0??2019-03-28?11:07??Keras_maskrcnn\model\__init__.py
?????文件????????8040??2019-03-28?10:08??Keras_maskrcnn\nuclei_ensemble.py
?????文件???????22907??2019-03-28?10:15??Keras_maskrcnn\nuclei_inf.py
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?????文件????????4180??2019-03-28?10:02??Keras_maskrcnn\nuclei_postprocess.py
?????文件????????8249??2019-03-28?11:30??Keras_maskrcnn\nuclei_train.py
?????文件????????2090??2019-03-28?10:05??Keras_maskrcnn\nuclei_trainvalsplit.py
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?????目錄???????????0??2019-03-28?11:07??Keras_maskrcnn\utils\
?????文件???????41692??2019-03-28?10:05??Keras_maskrcnn\utils\nuclei_utils.py
?????文件???????????0??2019-03-28?11:06??Keras_maskrcnn\utils\__init__.py
?????文件?????????292??2019-03-28?11:02??Keras_maskrcnn\__init__.py
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