資源簡介
在產酸博德特氏菌中鑒定出的含鋅酶HDAC樣酰胺水解酶(FB188 HDAH)與參與表觀遺傳機制(例如組蛋白修飾)的酶相似。 FB188 HDAH與拮抗劑SAHA(suberoylanilide異羥肟酸)復合的X射線晶體結構已得到解決(PDB ID:1ZZ1)。 值得注意的是,絡合物在晶體的不對稱晶胞中結晶為四聚體。 該晶體產生合適的結構以分析SAHA對該組蛋白脫乙酰基酶的抑制機理的動力學。 應用計算化學技術和量子力學理論,計算了幾種物理化學性質,以比較四種單體的酶的活性位點。 在結合袋的面積和體積以及疏水相互作用,偶極矩,原子電荷和靜電勢等方面觀察到了顯著差異。 值得注意的是,通過評估SAHA
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